1、辦公室
負責擬訂並組織落實本系統發展規劃、年度工作計劃、有關工作制度；組織信息采編，起草和審核重要文稿；負責機關文電、機要、會議、檔案、督辦、信訪、保密、密碼、安全等行政事務工作；承擔機關政務公開、政府信息公開工作；負責系統裝備、固定資產和後勤管理工作；承擔系統政府采購和基本建設；承辦政府目標考核工作；組織辦理人大代表議案、建議和政協委員提案的有關事項。
2、政策法規處
負責擬訂並組織實施依法行政、依法治稅工作方案；組織協調涉及多稅種、綜合性稅收政策的落實工作；組織開展綜合性稅收政策調研、執法監督和普法教育等工作；承擔機關規範性文件的合法性審核、備案等工作；牽頭重大稅收案件審理及規範稅務行政審批工作；承辦行政復議、行政訴訟和行政賠償等工作。
3、勞務和財產行為稅處
負責組織實施營業稅、資源稅、財產行為稅等稅收政策管理工作；組織實施有關稅種的納稅評估、稅源管理等辦法；指導、協調、檢查有關稅收法律法規和國家（地區）間稅收協議、協定（安排）的執行；牽頭組織實施特別納稅調整工作，解釋和處理國際稅收具體業務問題等。
4、所得稅處
負責組織實施企業所得稅、個人所得稅政策的管理工作；組織實施有關稅種的納稅評估、稅源管理、稅基管理、匯算清繳等辦法。
5、基金（費）處
負責社會保險費、文化事業建設費、水利建設基金、殘疾人就業保障金、城鎮居民醫療保險和教育費附加、地方教育附加費等基金（費）的政策管理工作，擬訂單項基金（費）征收管理具體實施辦法；開展政策調研，擬訂相關政策，對具體業務問題進行解釋和處理；指導基金（費）的日常管理和檢查；負責有關基金（費）的政策宣傳、繳費輔導、咨詢服務、法律救濟等工作。
6、收入規劃核算處
負責編制稅收（基金、費）收入中長期規劃、年度計劃；監督檢查稅收（基金、費）繳納、退庫情況；承辦稅收（基金、費）收入分析、預測和收入能力估算及重點稅（基金、費）源監控、企業稅收（基金、費）資料調查工作；擬訂並組織落實稅收（基金、費）會計、統計等相關制度；承擔稅收（基金、費）收入數據綜合管理應用和票證管理工作。
7、納稅服務處
承擔納稅服務體系建設有關工作；擬訂納稅服務具體工作規範和操作規程；組織協調、實施納稅（繳費）輔導、咨詢服務、爭議調解、稅收法律救濟等工作，受理納稅（繳費）人投訴；承擔地方稅收信用體系建設；組織實施面向具體納稅人的稅收政策宣傳；參與註冊稅務師管理。承擔對大型企業的納稅服務、評估和檢查工作。負責辦稅服務廳、“12366”熱線等納稅服務平臺建設、管理工作；承辦市政府交辦的招商引資工作。
8、征管和科技發展處
負責組織落實綜合性稅收征管法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體操作辦法；負責征管改革的組織實施，完善征管規程，推進專業化征收管理；組織實施征管數據管理和應用辦法、綜合性納稅評估辦法，承辦征管質量考核、風險管理和稅收收入征管因素分析工作；承擔稅務登記、納稅申報、普通發票管理、稅控器具推廣應用等工作；組織落實個體和集貿市場稅收征管、稅收管理員制度；承辦稅收管理信息化建設中業務需求整合和流程優化綜合管理工作。負責派駐市行政服務中心（行政審批）地稅窗口日常管理工作。
9、政治部
負責機構編制、人事管理、隊伍建設、教育培訓、思想政治和系統黨建等工作；承擔所轄縣地方稅務局領導班子及相當級別幹部管理有關工作；承擔科級後備幹部管理有關工作；負責股以上幹部更新知識培訓和系統業務骨幹培訓；負責系統學習型機關建設；負責系統人員工資、津貼補貼和職稱管理等工作；承擔機關和系統外事工作，辦理出國政審事項。負責貫徹落實老幹部及離退休工作政策；負責機關離退休人員的服務管理，指導系統離退休工作。
10、財務管理處
負責擬訂並組織落實系統財務管理辦法，負責系統經費和財務管理工作；編制財務預決算；組織實施會計核算、基礎規範工作，分析考核征稅成本；負責系統服裝配發、管理。
11、內審處
承擔系統財務、基建、大宗物品采購審計和領導幹部經濟責任審計等工作；負責市地稅局機關及所屬單位財務收支審計工作；督察落實各類審計結論。
12、宣傳處
負責重大課題的調查研究，組織指導本系統開展調查研究；負責內部信息編發、刊物編輯；承擔面向社會的稅收（基金、費）宣傳、新聞發布和對外宣傳報道；負責系統地稅文化建設、機關圖書閱覽室管理，指導基層單位圖書閱覽室建設和管理；承辦網站和綜合辦公平臺建設、管理工作。
13、監察室
監督檢查本系統貫徹執行黨的路線方針政策和遵守國家法律法規、部門規章情況；監督檢查本系統各級領導班子及其成員維護黨的紀律、貫徹黨風廉政責任制和廉政勤政情況；組織協調本系統黨風廉政建設和反腐敗工作；受理對本系統工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及有關申訴；查處本系統工作人員違法違紀案件及其他重要案件；開展執法監察和糾風工作。
14、機關黨委
負責機關和直屬（派出）單位的黨建和工青團婦工作，協助開展思想政治工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作以及發展黨員工作；承擔各類精神文明創建；承擔扶貧、統戰工作。
15、信息中心
負責全局信息化建設，內設硬件管理科、軟件開發管理科、系統運行維護科等股級科。
16、機關服務中心
承擔機關接待、安全保衛、環境衛生和後勤服務工作。內設公務接待科、後勤保障科等股級科。