市政府辦公廳（市政府參事室）
組成部門
市發展改革委 市財政局 市經濟信息委 市教委 市科委 市城鄉建委 市交委
市農委 市商委（市糧食局） 市外經貿委（市政府口岸辦） 市公安局 市監察局 市民政局 市司法局
市人力社保局 市國土房管局 市環保局 市規劃局 市市政委 市水利局 市文化廣電局（市文物局）
市衛生局（市中醫管理局、市愛衛辦） 市人口計生委 市審計局 市移民局（市三峽水庫管理局） 市民宗委 市政府外事僑務辦（市政府港澳辦）
直屬機構
市地稅局 市工商局 市質監局 市新聞出版局（市版權局） 市體育局 市安監局 市統計局
市林業局 市旅遊局 市扶貧辦 市政府法制辦（市政府行政復議辦） 市政府研究室 市機關事務局（市接待辦） 市金融辦
市民防辦
特設機構
市國資委
市政府部門管理機構
市物價局 市中小企業局（市鄉企局） 市農綜辦 市監獄局 市勞教局 市藥監局
市政府直屬事業單位
市園林局 市檔案局（市檔案館）
市政府派出機構
北部新區管委會（經開區管委會、高新區管委會） 市政府駐北京辦 市政府駐上海辦 市政府駐廣東辦 市政府駐四川辦
其它機構
市編辦 人行重慶營管部 市供銷總社 市文化執法總隊 市政府新聞辦 市氣象局 市信訪辦