壹個新的政權建立後，首要的就是清除異己，鞏固統治，殺害前明在成都的官員是必然的，下令屠城三日也是可能的。三日之後，每日壹小殺，這正是歐洲傳教士利類思和安文思二人所著《聖教入川記》所描寫的內容。然而我們不認為張獻忠的屠殺是瘋狂而毫無目的的。秦始皇坑殺趙兵是擔心他們造反，蒙古人殺漢人是為了削弱漢族。通過殺人來樹立威望，防止敵人的反撲，這是人類歷史上血腥的事實。後來的青羊宮殺士，同樣是這壹道理。“天下未亂蜀先亂，天下已治蜀後治”，四川自古文化思想發達，人們自我意識和反抗意識較強。張獻忠正是認識到知識分子對其政權的威脅，於是重演了壹出秦始皇“焚書坑儒”的慘劇。
可以說，張獻忠殺人是為了鞏固政權而采取的暴力手段，但是這並不等同於屠城。然而，歷史是殘酷的。在朝代更叠之際，常常是壹將功成萬骨枯。作為常識，造成人口大量減少的原因主要有以下幾個：首先是自然災害的破壞，往往壹次大規模的水災或者旱災可以造成幾十甚至幾百萬人死亡；其次是戰爭，明朝末年戰火連綿，不論是軍隊還是百姓都是戰爭的犧牲品，幾十年的戰爭造成幾百萬人死亡在歷史上並不罕見；再次是瘟疫，往往發生在大的自然災害和戰爭之中或之後，爆發速度快，死亡人數更會急劇增加。
綜上所述，造成明末清初成都十室九空的慘狀，戰爭是首要原因，自然災害的因素也存在，瘟疫作為戰爭的附屬品，更是難以避免。人為屠殺，絕對不是主要原因。將這壹切都歸結為張獻忠的屠殺，顯然是不公允的。真相應該是多個軍事集團連年混戰、天災、瘟疫、饑餓等多重的打擊，才使得美麗富饒的天府之國變成了人間地獄。
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