如果只去香港，要辦理香港簽註，如果只去澳門，要辦理澳門簽註。去港澳的話，兩個簽註都要申請。
辦理時限:受理之日起10個工作日(首次申請或非首次申請)。但郵寄日(壹般五天左右)和節假日不包括在內。
費用:每本80元的往來港澳通行證；壹張兌換簽註，每張15元，兩張兌換簽註，每張30元。
經辦人:第壹次辦理港澳通行證的，需要攜帶身份證和照片；如果不是第壹次申請，需要帶上身份證和之前的通行證。如果請人代勞，需要帶上代理人的身份證。
擴展數據:
壹、手續費
1，證書和背書
2017年7月起，港澳通行證收費標準由100元/次下調至80元/次。壹次有效簽註由每件20元降為15元，短期(不超過壹年)多次有效簽註由100元降為80元，長期(三年以上，含三年)多次有效簽註由300元降為240元。
2.特快專遞服務
新/補辦港澳通行證單程特快專遞服務:65438元+08。
港澳通行證續簽EMS雙向(證件回執+提交+取證+投遞)四向辦理服務:25元。
港澳通行證續簽EMS雙向(收件+提交+取證+投遞)四向辦理服務:45元。
第二，處理時間
申請往來港澳通行證及簽註:15個工作日。
網上申請和電話申請簽註8個工作日；窗口申請，EMS代辦申請簽註18工作日。
三、接收方式
我領取:本人申請領取並繳費，攜帶身份證或戶口本到受理申請的出入境管理處。
他人代理:代理人攜帶申請回執、本人身份證、護照申請人身份證明復印件到出入境管理處領取。
EMS上門:辦理港澳通行證當日，持申請回執到出入境管理處郵政快遞櫃臺辦理手續並繳費。
第四，電子文件
2014年5月，公安部在廣東推出電子往來港澳通行證，5月20日起接受申請。即將推出的電子通行證包含數字個人數據和指紋信息，可用於通過口岸自助查驗通道實現自助通關。
電子往來港澳通行證啟用後，內地居民往來港澳通行證管理政策不變，證件受理渠道和審批條件不變，收費標準不變。現行往來港澳通行證及簽註在有效期內可繼續使用，本通行證持有人可繼續申請貼紙簽註。
1，完全啟用
據網易等媒體報道，自14、15年9月起，電子港澳通行證正式在全國上線。據了解，電子版港澳通行證印有持證人照片及姓名、出生日期、簽發機關、簽發地點等簽發管理信息，背面印有往來港澳簽註信息。
簽註信息可被出入境管理部門反復擦除，不貼簽註，減少了因簽註頁已滿而更換的情況，降低了使用成本。
2、不需要貼紙
電子往來港澳通行證是參照相關國際標準設計制作的卡式證件。它嵌入了非接觸式集成電路芯片，存儲持有人的個人數據、證書和簽註簽發管理信息。有成熟的數字安全防偽機制保護。在印刷過程中，還采用了多項物理防偽技術，防偽能力明顯增強。
新版通行證正面打印持證人個人資料和制證管理信息，背面打印往來港澳簽註等信息。證書發行機構可以重復擦除背書信息。新版通行證不再附帶貼紙背書。
內地和港澳口岸查驗部門不再加蓋查驗印章，簽註使用情況由計算機信息系統記錄管理。如有必要，持證人可向內地及港澳主管機關查詢簽註剩余次數。
3、需要采集指紋
根據《中華人民共和國出境入境管理法》的規定，經國務院批準，公安機關出入境管理部門將對首次申請往來港澳電子通行證的申請人采集或者驗證指紋。保留指紋後，符合條件的持證人在通關時可以使用內地和港澳口岸的自助查驗通道。
為確保持證人指紋信息的安全，中國大陸、港澳主管部門建立了嚴格的管理制度，采取了多種技術保護措施。存儲在芯片中的持有者的指紋模板信息不能被恢復為原始指紋圖像。？[8]?
4.收費標準不變。
電子往來港澳通行證及簽註收費維持不變。電子往來港澳通行證啟用後，仍有效的現有往來港澳通行證(本表)和往來港澳簽註(貼紙式)可繼續使用。持此類往來港澳通行證的人員可繼續申請粘貼式往來港澳通行證簽註。
參考資料:
百度百科-中國人往來港澳通行證