醫保中心的主要職責包括本市行政區域內基本醫療保險、補充醫療保險、靈活就業人員醫療保險、重大疾病醫療補助、公務員醫療補助等醫療保險服務的管理。
社保中心是人力資源和社會保障局(原勞動和社會保障局)下屬參照公務員管理的事業單位。社保中心是全國社會保險基金和社會保險經辦業務的綜合管理機構，中國人力資源和社會保障部是統籌管理和統籌城鄉就業和社會保障政策的機構。