1，下屬級別不同，權限有差異。
縣政府由地級市政府或行政公署直接管理，縣級市壹般由省政府直接管理，由地級市政府代管。由於下屬層級不同，縣級市政府的管理權限比縣政府大壹點，往往擁有“副地級市”的審批權限。省裏會給縣級市壹些優惠政策，比如每年增加財政周轉金200萬以上。
2.不同的城市化進程有不同的職能重點。
縣政府職能重心在農村，縣改市後城市化進程加快。縣級市政府的職能必須同時考慮城鄉管理，註意協調城鄉關系，其中壹項就是城市建設，這是與縣級政府的關鍵區別。縣級市普遍加大城市建設力度，從各方面入手，實現高標準的城市建設。
3.市縣名稱不同，衡量政府效能的標準也不同。
縣改市後，衡量政府工作效率的標準更高了。第壹，省級和地級市政府對縣級市政府的要求高於縣級政府，機構改革的試點往往放在縣級市。第二，公民對市長形象的要求高於對縣長形象的要求。市長形象是市民以完整的要求和標準對市長的總體印象和評價。
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