1，證書性質不同。高級會計師屬於職稱證書，分為初級會計職稱、中級會計職稱、高級會計職稱；註冊會計師是執業證書，分為非執業註冊會計師和執業註冊會計師。
2.適用條件不同。高級會計師任職資格:具有大學專科學歷，取得會計師職稱後從事與會計師職責相關的工作滿10年；具有碩士學位、第二學士學位、研究生班畢業、學士學位或者學士學位，取得會計師職稱，從事與會計師職責相關的工作滿5年；具有博士學位，取得會計師職稱後，從事與會計師職責相關的工作滿2年。
3.考核方式不同。高級會計師是在壹個組合的評估。考試科目為《高級會計實務》，考試結束後將進行高層會議復習。註冊會計師考試分為專業階段考試和綜合階段考試，五年內通過專業階段考試所有科目才有資格報名綜合階段考試。
4.考試難度不壹樣。註冊會計師考試的難度是業內公認的第壹。專業階段的六科涵蓋會計、審計、法律、管理等多個方面。包含的知識面廣，難度有目共睹。通過考試的考生往往需要備考3-5年。所以對於大部分申請人來說，註冊會計師是很難的。