根據上述職責，區教育局設8個內設機構。
（壹）辦公室
負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作以及政務公開、新聞發布、來信來訪、安全保密、政務應急工作；負責系統綜合治理、行政執法；負責區人大、政協提案、建議辦理；負責系統黨建、紀檢、工會、群團組織、計生工作。負責中小學教師的表彰獎勵工作。
（二）人事師資股
承擔局機關和直屬單位幹部人事工作，指導區直學校的人事工作；負責全區教師工作，組織實施教師資格制度；加強對全區中小學教師工作的統籌、規劃、管理，依法落實縣級教育行政部門履行中小學教師的資格認定、招聘錄用、職務評聘、考核獎懲、調整流動等職責；指導教育系統人才隊伍建設工作；承擔大中專畢業生就業指導與服務工作；負責機關離退休人員管理服務工作，指導直屬單位的離退休幹部工作。
規劃、指導全區中小學、幼兒園教師師資培養培訓、繼續教育、業務考核和骨幹教師隊伍建設；指導全區中小學教育幹部培訓工作；指導區教師進修學校的教學管理和質量監控工作；組織指導全區教師教育方面的國內外合作與交流。
（三）計劃財務股（掛基建股牌子）
擬定全區教育事業發展規劃；擬定各級各類學校招生計劃；承擔教育基本信息統計、分析和發布工作；參與擬定教育經費籌措、教育撥款、學生資助政策；承擔統計全區教育經費投入情況的有關工作，監測全區教育經費的籌措和使用工作；參與義務教育保障機制經費、有關教育專項經費管理；負責教育部門經費預算和決算；承擔全區教育系統的內部審計和財務檢查及糾風工作；負責區直學校、事業單位國有資產管理工作；負責全區教育基本建設和校舍維修改造工作，監督落實各級各類學校建設標準。負責局機關財務、資產及接待食宿工作。
（四）基礎教育股
承擔義務教育、特殊教育的宏觀管理工作，會同有關方面提出加強農村義務教育的政策措施，擬定推進義務教育均衡發展的目標、政策，提出保障各類學生平等接受義務教育的政策措施；負責落實義務教育辦學標準，規範義務教育學校辦學行為，推進教育教學改革；擬定幼兒教育、特殊教育的發展政策和基礎教育的基本教學文件；指導民辦普通中小學校教育教學管理工作；宏觀管理全區中小學教材建設，組織落實地方教材，指導全區中小學開發校本教材，推進基礎教育課程改革；指導中小學教學信息化、圖書館和實驗設備配備工作；承擔義務教育學生學籍學歷管理工作。指導中小學體育、衛生與健康教育、藝術教育、國防教育工作，擬定落實相關政策和教育教學指導性文件，宏觀管理相關專業的教材建設；組織和協調中小學生參加體育競賽和藝術交流活動；指導中小學校的軍訓工作；協助有關部門開展學校疫病防控、食品衛生工作。
（五）職成教育股
承擔全區中等職業教育統籌規劃、綜合協調和宏觀管理工作；擬定有關政策規定和教學指導文件；落實中等職業教育教學基本要求；指導中等職業教育教學改革工作工作；指導中等職業學校教師培養培訓和學籍管理工作；指導中等職業學校的德育工作、思想政治工作和安全管理；指導民辦職業中學教育教學管理工作。
承擔全區成人教育以及掃除青壯年文盲的宏觀指導工作；指導農村成人教育和農村教育綜合改革工作，會同有關部門指導全區計算機應用能力培訓與考核、職工教育、崗位培訓、農民實用技術培訓和農村富余勞動力轉移培訓工作；指導全區社區教育工作和學習型組織建設；承擔民辦教育的統籌規劃、綜合協調和宏觀管理的有關工作，牽頭擬定民辦教育有關政策規定及審批和管理民辦中等及中等以下非學歷教育教學機構；承擔全區成人高考工作。
（六）學前教育股
承擔全區幼兒教育的宏觀管理工作；擬定全區幼兒教育的發展政策和基本教學文件；承擔全區幼兒園註冊登記與評估定類工作；指導全區學前教育機構教科研工作；組織幼兒園園長、教師培訓，實施持證上崗；對0-6歲兒童家長進行科學育兒知識的宣傳指導。
（七）思想政治教育股
指導中小學黨的宣傳工作、精神文明建設工作和德育工作；承擔中小學學生與教師的思想政治工作；指導中小學班主任、輔導員隊伍建設和培訓工作；指導中小學校園文化建設工作；規劃、指導中小學校外教育工作；指導全區教育系統關心下壹代工作。
（八）安全法制科
指導全區各級各類學校的安全保衛、政治保衛、綜合治理和維護穩定工作；承擔教育系統突發公***事件的應急管理工作；指導學校開展不穩定因素排查工作；協調學校重大安全與穩定事件處置及有關專項整治工作；指導學校安全教育和學生預防違法犯罪工作；承擔教育系統反邪教防範控制、宣傳教育和教育轉化等工作。研究教育改革與發展戰略並就重大問題進行政策調研；起草教育地方性規章草案；承辦全區教育系統法制建設和依法行政的有關工作；承擔局機關有關規範性文件的合法性審核工作，承辦局機關行政處罰聽證、行政復議、行政應訴、行政賠償及其他法律事務。