故事主線是葉月在她的那個世界裏面愛上了和自己壹起生活的初美,但初美在16歲生日的時候突然消失了,受神秘生物KEN-CHAN（黃色肥鸚鵡）的引導,葉月在大圖書館見到了莉莉絲,並得知初美就是夏娃,而莉莉絲也因為葉月容貌酷似亞當而愛上了她……在這裏,葉月知道了初美原來就是eve,也知道了初美現在在某個世界裏面,於是執著的她便和莉莉絲壹起在各個時空尋找eve。在每個世界裏面都有壹個相對獨立的小故事,有列車上驚險刺激的間諜情報戰；有原始人部落；孤島裏長不大的少女；竹姬的傳說；人類未來的太空移民等等，最後，尋找eve的各路人馬在宇宙庭院相遇了,在這裏,他們終於碰到了日夜追尋的