在整個20世紀30年代，阿根廷的政權壹直在軍人獨裁者和舞弊選出的總統之間交替。在種族（其人口93％以上是白人）、文化、政治和經濟方面，阿根廷是和歐洲緊密聯系在壹起的，其軍政府甚至以恢復舊日“西班牙的十字和劍的聯盟”的名義與佛朗哥加強了聯系。有些人甚至要求取消獨立，重新從西班牙派遣總督作為阿根廷的統治者。在梵蒂岡的慫恿下，阿根廷軍政府和教會還夢想在南美建立壹個西班牙化的天主教國家，與美國分庭抗禮。阿根廷駐西班牙大使埃斯科瓦爾（Adrian Escobar）奉命與德國和梵蒂岡的官員進行會談，商討合作事宜。他與梵蒂岡教皇廳秘書長馬吉奧尼樞機主教（Luigi Magione）進行會晤後達成了壹份協議，壹旦戰爭結束，阿根廷就實行更為寬大的新移民法，從而為戰爭末期納粹要員從梵蒂岡到阿根廷的“逃亡之路”打下了基礎。
二戰爆發後，阿根廷分成兩個陣營:政府、軍人和大資本家支持納粹，民眾則支持盟國。歐洲戰事剛壹爆發，軟弱的代總統卡斯蒂略（Ramon Castillo）就宣布中立。盡管阿根廷國會已經批準了1940年哈瓦那決議－對任何壹個西半球國家的進攻都被視做對所有美洲國家的入侵，但它在珍珠港事件後依然堅持中立，拒絕對德日宣戰。阿根廷政府深信德國將會獲勝，並將控制歐洲，因此與其保持良好關系至關重要，甚至在1942年初兩艘阿根廷商船被德國潛艇擊沈後仍決心與其保持友好。作為回報，德國不僅賠償了阿根廷的損失，而且答應說只要阿根廷船只把航行路線和時間通知他們，德國海軍將保證其安全航行。
1942年1月，美洲國家組織成員國在巴西裏約熱內盧召開會議，商討西半球國家的戰時政策。會後通過了《裏約熱內盧協定》，簽字國保證與軸心國斷交、宣戰，並凍結和沒收軸心國在這些國家的資產。作為回報，美國將按租借法案向這些國家提供武器，以及軍事和經濟援助。阿根廷沒有簽署該協定。直到1942年6月在華盛頓召開的美洲經濟與財政管制會議後，阿根廷才在表面上終止與軸心國的所有商業活動，但私下裏仍偷偷與納粹進行貿易往來。
阿根廷的虛假中立壹直維持到1943年6月4日，此後則義無返顧地倒向了納粹。在民眾的強烈要求下，卡斯蒂略總統被迫就阿根廷是否參加西半球防禦體系和對軸心國宣戰的問題舉行全民公決，納粹分子、長槍黨、軍官集團和大地主隨即在6月4日發動了反全民公決的“上校政變”。這些上校們剛壹掌權就向德國求購軍火，以對巴西開戰。到1943年9月，他們轉而開始尋求與納粹結盟，並派遣特使到西班牙與納粹官員進行談判。美國的反情報機構截獲了阿根廷的納粹特工頭目貝克（Johan Backer）與黨衛隊保安處頭子瓦爾特．舒倫堡的通訊，隨即迅速通知英國海軍，在特立尼達攔截了阿根廷秘使乘坐的客船。不過盟國未能阻止上校們更進壹步的陰謀:庇隆和貝克繼續策劃推翻鄰國的政府，以在南美建立壹個親納粹聯盟。庇隆曾在壹份秘密宣言中寫道:“……我們已經有巴拉圭，玻利維亞和智利。再加上阿根廷，很容易向烏拉圭施加壓力。五個聯合起來的國家是很容易擊垮巴西的。巴西的政治體制和其廣大的德國移民也是有利因素。把巴西拉進來之後，美洲大陸就盡在我們掌握了。”
在戰爭期間，由於阿根廷政府的配合，大多數在阿根廷的德國公司將其利潤交給當地的納粹間諜組織，成為其活動經費。美國財政部還懷疑阿根廷為軸心國“洗”了大量的外匯，接收大批納粹掠奪的貨幣和證券，並使其進入美國市場。阿根廷還充當了納粹的供貨商。盡管大宗的貨物如小麥、牛肉等很容易被盟國攔截，但小規模的走私－比如德國急需的工業用金剛石和白金－仍源源不斷地從阿根廷流往德國。珍珠港事件之後，摩根索曾想立即凍結阿根廷的資產。1942年5月，他向羅斯福總統遞交了證據，表明眾多的阿根廷公司正在為美國境內的德國資金提供掩護，並將價值1000多萬美元的納粹資金帶入美國以使其合法化。然而直到1942年10月羅斯福才同意國務院對選定的阿根廷賬戶進行凍結。超過150家阿根廷公司和個人被列入了國務院的黑名單。
1943年12月20日，烏拉圭發生了未遂軍事政變。通過攔截、破譯德國特工發回國內的情報，美國從中揪出了阿根廷的黑手。美國威脅要公布這些材料、將阿根廷開除出美洲國家組織、並對其實施制裁。在這樣的威脅下，阿根廷被迫作出讓步，於1944年1月同德國斷絕了外交關系。然而此後阿根廷繼續保持中立。在戰爭的最後年月中，阿根廷是鮑曼藏匿納粹財產的主要目的地，也是納粹戰犯在戰後的主要避難所。
美阿之間關於“安全港計劃”的談判於1944年開始，但由於兩國間的緊張關系而受到極大的限制。1944年2月，因顛覆烏拉圭和玻利維亞政權的醜聞敗露，阿根廷軍人總統拉米雷斯將軍被迫辭職，將權力轉交給了法雷爾將軍，庇隆擔任副總統。美國宣布不承認法雷爾政府，並召回了駐阿根廷大使。8月5日，阿根廷外長給美國國務卿赫爾寫了壹封長信，表示不準備改變其外交政策，因為“同正在面臨失敗的軸心國斷絕關系是不符合阿根廷的騎士精神的”。他還在信中試圖分享美國的租借法案武器援助，赫爾抓住這個機會在回信中好好羞辱了阿根廷壹番。8月16日，阿根廷儲存在美國的黃金被全部凍結。9月，美國商船被禁止駛往阿根廷港口。做為回應，阿根廷退出了西半球防禦體系，其央行停止協助美國調查納粹財產。
態度強硬的赫爾因病辭去國務卿職位後，繼任者斯退丁紐斯對阿根廷采用了更溫和的政策。負責拉美關系的助理國務卿納爾遜．洛克菲勒也支持溫和路線。值得註意的是，正是洛克菲勒家族旗下的銀行在戰爭期間從阿根廷非法吸收了大量納粹資金，也正是納爾遜．洛克菲勒的美孚石油公司通過西班牙向德國運去了大量石油。
1945年2月7日，摩根索建議代理國務卿格魯（Joseph C．Grew）派壹支特別代表團去阿根廷，查找並沒收納粹在那裏的資產，格魯出於政治方面的考慮駁回了該提議。1945年初，在墨西哥查普恰佩克城舉行的美洲國家組織會議上，美洲國家（阿根廷除外）通過決議認可了各國家處理本國納粹財產的自由權。由於阿根廷繼續支持納粹德國，它被排除在這次會議之外。直到希特勒自殺前壹個月，由於意識到被西半球其它國家孤立，特別是美國準備采取更為嚴厲的制裁，阿根廷才不情願地向德國宣戰。
1946年5月22日，“安全港計劃”成員報告說在阿根廷的德國資產大約為2億美元，包括銀行存款、房地產和各類貨物，但未發現有藝術品和珍寶的藏匿處，他們錯誤地斷定阿根廷並不是壹個主要的納粹贓物藏匿地。此外，盡管早在1942年美國就獲知阿根廷和德國的非法貨幣交易，該報告卻說並沒有證據顯示阿根廷接收了納粹的黃金。1942年4月，美國駐瑞士領事報告說，壹位阿根廷外交官正在將納粹掠奪的美元偷運回國銷售，然後將獲得的現金匯寄回瑞士。英國情報機關也在1944年查出阿根廷與瑞士之間密切的貿易往來，而且經常用黃金作為支付手段。1947年5月，阿根廷中央銀行計劃將1．7億美元的黃金轉移到其聯邦儲備局的賬戶上，後因擔心美國追查黃金來源而推遲了計劃。1973年庇隆重新掌權後，曾將他的400噸黃金投入黑市進行交易。庇隆貨物的代號是“鮑曼1345”，買主是西班牙政府。銷售人員自然將這批貨物與政治掛上了鉤。但沒人追查這些黃金的最終來源是哪裏。
由於冷戰的原因，“安全港計劃”在阿根廷也無疾而終。1947年6月3日，杜魯門總統和阿根廷大使發布壹份聯合聲明:兩國將與其它拉美國家重新商議建立新的互助條約組織。1947年9月，阿根廷加入了美洲互助條約，即《裏約熱內盧條約》，鮑曼在阿根廷隱匿的公司和財寶安全地保存了下來。這時美國西半球的主要目標是扼制***產主義，對納粹戰犯和納粹黃金已無暇顧及。盡管阿根廷的黃金儲備飛速增長，大量的納粹戰犯也藏匿在那裏，可調查者們直到半個世紀後“仍未發現”阿根廷曾大量接收納粹黃金的直接證據。