消失原因：
1.人口爆炸，瑪雅人居住的地區不大，營造的居住城市更小。在如此狹小的面積上，人口無節制的繁殖，興盛時期曾達到數百萬人口。當承受能力崩潰時，其頭領必然會作出壹定的決斷，從而導致大規模、閃電般的移民，瑪雅幾乎在壹夜之間成了孤城。
2.自然災害，中美洲是強烈地震曾經發生的地方，該地區歷史上曾出現震級較強的地震。而中美洲的部分地區深受臺風、颶風之苦。歷史上瑪雅人所居住的地區，難免遭受地震之害和風災之苦。頻繁出現的自然災害，瑪雅人很自然的會考慮退卻之路。
3.疾病傳播，據考證瑪雅人昌盛時，居住地區是比較文明衛生的，而且醫療條件高於周圍的人類。然而通過相鄰的人類侵擾和交流，把當時存在的種種傳染病，傳播到了瑪雅人的居住區，從而導致傳染病的流行。其頭領為了避開疾病的傳播，毅然決定離開當時的居住地。
4.星外決策，瑪雅人的祖先很可能是外星人，當瑪雅人人口劇增、糧食不足、自然災害等導致困難重重、矛盾層出，使之不能自拔時，外星世界的祖先會作出大轉移的決策，下達動遷的命令。
5.能源匱乏，據推測瑪雅人當時還沒有電力作能源，也不可能利用煤炭或者石油作燃料，沒有發現用風作能源或動力的痕跡，只能認為是依靠太陽的熱能為生活服務。隨著人口的急劇增加，能源的匱乏便是壹件急切需要解決的問題。其頭領可能因為能源的嚴重供不應求而尋求移民的措施。
參考資料
百度百科-瑪雅文明