卓資縣醫保局是卓資縣人民政府的工作部門，正科級。縣醫療保障局貫徹黨中央、自治區黨委和烏蘭察布市委關於醫療保障的方針政策，落實縣委有關決策部署，在履行職責過程中堅持和加強黨對醫療保障的集中統壹領導。其主要職責是:貫徹執行國家、自治區、直轄市有關醫療保險、生育保險、醫療救助等醫療保障制度的政策、法規和規章。
配合有關部門編制全縣醫療保障基金預決算草案，組織制定和實施醫療保障基金監督管理辦法，建立健全醫療保障基金安全防控機制，推進醫療保障基金支付方式改革。組織實施醫療保險籌資和待遇政策。組織實施藥品、醫用耗材、醫療服務項目、醫療服務設施等城鄉統壹的醫保目錄和支付標準，建立動態調整機制，落實國家醫保目錄準入談判規則。落實國家藥品和醫用耗材價格政策，落實醫療服務項目和醫療服務設施收費等政策，建立醫保支付的醫療服務價格合理確定和動態調整機制，推動建立市場主導的社會醫療服務價格形成機制，建立價格信息監測和信息發布制度。
組織實施藥品和醫用耗材招標、采購、配送和結算管理政策，並監督實施，推進藥品和醫用耗材招標采購平臺建設。組織實施定點醫療機構協議和支付管理辦法，建立健全醫療保險信用評價體系和信息披露制度，監督管理納入醫療保險範圍的醫療服務行為和醫療費用，依法依規查處醫療保險領域違法行為。負責醫療保障管理和公共服務體系及信息化建設。組織實施異地就醫管理和費用結算政策。建立健全醫療保障關系轉移接續制度。開展醫療保障領域的合作與交流。
醫保局的單位性質是國家行政機關，隸屬於地方人力資源和社會保障局。醫療保險局的主要職責:
1.負責受理基本醫療保險、工傷保險、生育保險和離休幹部醫療費用統籌基金的審批、支付、管理等日常事務。
2.為參加基本醫療保險、工傷保險和生育保險的用人單位、職工和離退休幹部提供相應的管理服務。
法律依據:《中華人民共和國基本醫療衛生與健康促進法》第八十二條，基本醫療服務費用主要由基本醫療保險基金和個人支付。國家依法多渠道籌集基本醫療保險基金，逐步完善可持續籌資和調整基本醫療保險保障水平的機制。公民有依法參加基本醫療保險的權利和義務。用人單位和職工按照國家規定為職工繳納基本醫療保險費。城鄉居民按規定繳納城鄉居民基本醫療保險費。