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有人說“臺灣”是古代神話傳說“岱嶼”和“員嶠”首字聯名“岱員”轉變而來的；也有人說“臺灣”是因盛行於閩臺地區的臺風而得名；還有人說“臺灣”原作“埋冤”，後因其詞不詳才改稱為“臺灣”的。意即“明代漳泉人入臺者，每為天氣所虐，居者輒病死，不得歸，故以埋冤名之，誌慘也。其後以埋冤不祥，乃改今名”（連橫：《臺灣通史·開辟篇》）。更多的人則主張“臺灣”之名來源於陳第所著《東番記》中的“大員”、周嬰《遠遊篇》中的“臺員”和顧炎武的《天下郡國利病書》中的“大灣”。“臺灣”則由“大員”、“臺員”、“大灣”等或因語音相同轉譯，或以當地部落名稱謂轉化而來的。例如《辭海》等都持這種看法。譚其驤等在《我國省區名稱的來源》臺灣省條中，闡明了“臺灣”名稱的演變過程和各個時期的地域所指。文中說，十六世紀時有“大員”之稱，本指今臺南安平鎮附近壹帶，是當地高山族部落名譯音。進入十七世紀“大員”又改寫成臺灣。其時荷蘭侵略者在該地所築的熱蘭遮（ZeeIandia）城，華人即稱之為臺灣城。1662年鄭成功驅逐荷蘭侵略者收復全島後，“臺灣”所指大致在今臺南市壹帶。清初建立臺灣府後，臺灣壹名所指地域才包括整個島嶼。另壹種看法，認為因荷蘭人在海灣修城築臺，故名“臺灣”。道光重刻本康熙《臺灣縣誌》雲：“荷蘭設市於此，築磚城，制若崇臺，其海濱沙環水曲曰灣，又泊舟處概謂之灣，此臺灣所由名也。”
此外，成書早於《東番記》的《日本壹鑒》的《窮河話海》和《桴海圖經》兩冊中，都把臺灣稱作“大惠”。吳壯達認為“大惠”與《東番記》的“大員”及後出現的“臺員”、“大灣” 都是對同壹地理對象的名稱從閩南方言轉化。他從安平古海灣“大灣”的轉化論證“臺灣”壹名由來於“大灣”。又據康熙《臺灣縣誌》所築城堡“制若崇臺”，“臺灣”的“臺”與“灣”兩字聯稱的含義才成立。1662年鄭成功收復臺灣後，“臺灣”壹名才被人們采用。邵秦在《臺灣名稱由來考略》（載《歷史研究》1982年第2期）壹文中不同意這種看法，認為臺灣閩音稱謂大員、臺員、大灣等，在荷蘭人侵臺前早已存在，在修城築臺前荷蘭人也隨中國人稱安平為“大員”；也不同意把“臺灣”之稱來源於大海灣的“大灣”壹名轉化而來，因為《東番記》並未記成大灣而寫成大員，《遠遊篇》作臺員。“大員”、“臺員”在字義上不能表示出海灣之意。“臺灣” 應由來於原安平地區土著臺窩灣族，以其族名稱其地，據調查確認臺南城的大灣莊為臺窩灣族原住地。“大灣”即“臺窩灣”的同音異字。荷蘭文獻中對安平壹帶有時寫成Tayovoan（臺窩灣），有時寫成Tyovon（梯窩灣）、Teijoan（大員）、Toyouan（臺員）等。
中荷兩國的兩種不同民族語言對該地稱呼基本壹致的記載，雄辨地證明了關於臺灣名稱最早來源的出處，即與臺灣安平壹帶土著臺窩族名稱有關。關於“臺灣”名稱的由來，目前雖仍存在分歧，但在辭書、報刊出版物中，涉及有關臺灣名稱來源的有其壹定的傾向性，很多專家、學者又都在積極研究探討這個問題，或許在不久的將來能揭開這個謎底。
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