日本人的祖先主要有兩支，壹是在18000年前就遷徙到日本的繩文人。另壹支是從公元前3世紀開始逐漸從中國和朝鮮遷徙過去的彌生人。這兩部分人的混血造就了今天的日本。如果按照今天中國的概念來劃分血緣，日本人確有壹部分中國人的血統，但由於彌生人來源復雜，而且之後又和繩文人混血，所以，不能因為其有壹部分中國人血統就說其是中國後裔。
日本人
繩文人，為東南亞古人，大約在公元前12000年遷徙到日本列島，由此開啟了日本的繩文文化時代。據日媒報道，現代日本人的基因組，約有15％來自於繩文人。繩文人比較矮小，男性身高不超過160，女性不超過150。
日本繩文人與東南亞古人的基因序列相似度更高，這從基因上證明了繩文人和東南亞的部分古人存在深度關聯，有助解開兩者的起源之謎。歷史上確實有許多中國大陸的移民，渡海來到日本，並成為現代日本民族的祖先。但是，我們不能因此說日本人就是中國人的後代。
除此以外，還有壹種說法是日本人是徐福渡海時帶領的童男童女的後代，所以就有人根據外貌大膽推測漢族人是日本人的祖先，並且還聯想到了壹段傳說——徐福東渡。徐福乃鬼谷子的關門弟子，擅長氣功、修仙、武功，秦始皇壹統六國之後想要長生不老，穩握皇權，所以就派遣徐福出海尋找仙人以求長生不老。徐福就帶著三千童男童女和水稻谷物遠渡重洋，推測在日本安家落戶了。
徐福雕像
實質上，如今的日本人的血統構成十分復雜，把他們看作是“雜交”出來的人類比較恰當。從廣義人種上講，日本人屬於黃皮膚、黑眼睛的蒙古人種。日本島在20000多年前，就已經有原始土在居住，這類人被稱作“繩文人”，是地道的土著人。他們主要居住在今天日本的北海道壹帶，身材矮小，身體上體毛比較多，以打魚狩獵為生。
實質上，如今的日本人的血統構成十分復雜，把他們看作是“雜交”出來的人類比較恰當。從廣義人種上講，日本人屬於黃皮膚、黑眼睛的蒙古人種。