辦公廳：主管部令的公布，印信的典守，文件的收發繕校，圖書、資料、檔案的管理，會議的準備，督促決議的執行，聯系各司工作，本部人、財、物的各項工作等。
幹部司：主管由本部辦理的地方行政人員的任免、調動、調整，各級行政人員的銓敘、登記、統計、教育訓練，工作人員的福利等。
民政司：主管地方人民政權建設，地方行政機關的設置，行政區域的劃分調整、名稱和治所的厘定、圖誌的收集編印，疆界的測量勘查，水陸地圖的審查，戶籍、國籍的管理等。社會司：主管社會福利，遊民改造，社團和宗教團體的登記，公葬公墓，人民褒揚獎勵，移民，社會救濟等。
地政司：主管農村土地改革，土地的清丈、登記和頒發土地證，城市房地產政策，城市營建的計劃考核，公***房地產的保護，其他地政事項。
優撫司：主管烈、軍、工屬（指革命工作人員家屬）和革命殘廢軍人的優待撫恤，退伍安置和退休工作人員的處理，烈士褒揚追悼，烈士傳記編纂和事跡遺物的搜集保管，烈士紀念物的興建管理保護，優軍，其他優撫事項等。