船長需確保其船只上的人員遵守移民和海關法規，負責提供完整準確的航海日誌、報告、報表和文件，確保遵守根據國際海事組織因該船只需要而訂下的安全計劃。該計劃闡述了每個人的職務，包括進行搜查和檢查，維護有限的空間，並響應來自恐怖分子，劫機者，海盜，偷渡者的威脅。該安全計劃還包括其他主題，如難民和尋求庇護者，應付走私和破壞分子。最後，船長負責解決任何醫療問題，為受影響的乘客和船員提供醫療照顧，與岸上醫務人員盡可能的合作，並在必要時撤離那些需要更多援助的乘客和船員。
船長確保該船舶符合當地和國際法律以及公司的政策。船長是最終負責方面的操作，如安全航行的船舶，其清潔和適航性，安全處理所有貨物，管理的所有人員，庫存船舶的現金和商店，維護船舶的證書和文件。如果船上沒有司庫，船長負責船舶的會計。這包括確保有足夠數量的現金在船上，協調船舶的薪金（包括繪制及墊款），和管理船舶的汙油排放量