國家移民管理局第二總隊是副部級的單位，國家移民管理局是根據第十三屆全國人民代表大會第壹次會議批準的國務院機構改革方案組建，由中華人民***和國公安部管理。
全國公安邊防部隊現役編制全部轉換為人民警察編制，由國家移民管理局（中華人民***和國出入境管理局）領導。協調擬定移民政策並組織實施，負責出入境管理、口岸證件查驗和邊民往來管理，負責外國人停留居留和永久居留管理、難民管理、國籍管理，牽頭協調“三非”外國人治理和非法移民遣返，負責中國公民因私出入國（境）服務管理，承擔移民領域國際合作等。