萬福街道、丹陽街道、月城街道、澱湖屯街道、黃鎮街道、季晨、阪地鎮7個鎮(街道)，馬嶺崗鎮、呂嶺鎮、北城街道、牡丹街道、房山鎮、杜塘鎮6個鎮(街道)，規劃面積497.48平方公裏。
菏澤魯西新區堅持核心引領-引領、軸帶展開、融合互動的原則，構建“壹核集聚、兩軸引領、三區聯動、多點支撐”的總體布局。
壹個核心:即在新區主要建設用地空間建設公共服務核心區。發展商貿物流、金融保險、科研開發等現代服務業，完善文化、教育、醫療等公共服務功能，打造復合型公共服務中心。
兩軸:產業創新發展軸和現代服務業發展軸。產業創新發展的軸線從菏澤高新技術產業開發區延伸到航空港區，串聯起東、中、西部的幾個產業區。現代服務業發展軸，連接高鐵新城東西方向至新區科技創新中心、公共服務中心等多個功能區。
三區:西部高科技創新產業區，中部產城融合區，東部高鐵和現代產業區。菏澤高新技術產業開發區是西部高新技術創新的主要產業區，重點發展生物醫藥、新壹代信息技術、新能源和新材料。產城中心整合區包括老城區綜合服務區和日蘭高速以西的工業發展區。京九鐵路以東，重點發展新壹代信息技術、高端裝備制造、現代商貿物流等產業。