壹般審計單位和業主是按照結算費用的比例來支付審計費用的，這個系數根據不同的項目是不壹樣的，可以是2%，也可以是3%。此外，超出審計費用的5%部分由施工方按照5%的審計費支付。
無論設計哪壹級審計事務所，都不允許收取審計費用，事務所審計的審計費用由誰支付，由甲乙雙方協商，協商不成，就是誰主張，誰負責費用。