1，不同險種。靈活就業人員社保只參加養老保險和醫療保險，部分地區可以參加失業保險。在職職工的社會保障包括養老保險、醫療保險、工傷保險、生育保險和失業保險；
2.繳費基數不壹樣。靈活就業人員按上年度全省職工月平均工資的40%-100%繳納。在職職工以本人上年度月平均工資為基數；
3.繳費比例不壹樣。靈活就業人員養老保險繳費比例為20%，醫療保險繳費以上年度城鎮職工月平均工資的80%為基數，基本醫療保險費按4.2%或8%的費率繳納；在職職工養老保險單位繳納20%，個人繳納8%；醫保單位繳納9%，個人繳納2%；失業保險單位繳納1%，個人繳納0.2%；生育保險單位繳納0.8%，個人不繳納；工傷保險單位繳納0.8%，個人不繳納；
4.支付主體不同。靈活就業人員和個人需要承擔全部社保費用。在職職工，繳納社保所需費用由用人單位和職工共同承擔，用人單位承擔大部分，職工承擔小部分。社保費由單位代扣代繳；
5.戶籍限制不壹樣。靈活就業人員和個人必須有當地戶籍才能繳納社保，沒有當地戶籍只能參加城鎮職工社保。在職員工，繳納員工社保沒有戶籍限制，只要是全職工作即可；
6.支付意願不同。靈活就業人員可根據自身實際情況決定是否繳納社保費用。在職員工必須按照規定繳納社保。
法律依據
《中華人民共和國社會保險法》第四條規定，中華人民共和國境內的用人單位和個人依法繳納社會保險費，有權查詢繳費記錄和個人權益記錄，要求社會保險經辦機構提供社會保險咨詢等相關服務。
個人依法享受社會保險待遇，有權監督本單位的繳費情況。