是的，目前深圳已經有99家醫院開通了省內異地就醫結算功能，但目前只針對在深圳醫院住院的市民。具體申請流程如下:
第壹步:記錄在案
①廣東省內異地醫保患者在這99家醫院就診時，醫生會根據患者的病情開具入院通知書。
②家屬憑入院通知書、患者身份證(或戶口本)、醫保卡等證件，到患者參保地社保部門辦理異地就醫，選擇深圳市99家定點醫院作為異地就醫定點醫院。
第二步:輸入信息
持當地社保部門開具的異地住院登記表、身份證(或戶口本)、醫保卡到住院費辦公室辦理異地住院登記。
第三步:結算
參保人符合出院標準時，憑出院通知單到住院收費處辦理網上結算手續。註意結算分為兩種情況，如下:
1.如果遠程醫療平臺驗證通過，患者出院就可以立即結算。
2.如果異地就醫平臺驗證不通過，患者出院時需要自費結算，並持相關資料回參保地社保部門報銷。
法律依據:
人力資源和社會保障部、財政部、國家衛生計生委指導意見(2014)，基本實現市級統籌地區異地就醫直接結算，015規範建立省級異地就醫結算平臺，016基本實現省內異地住院費用直接結算，016建立全國異地就醫結算平臺，全面實現退休人員跨省異地住院。
原則上執行居住地規定的醫療保險統籌基金支付範圍(包括藥品目錄、診療項目和醫療服務設施標準)，原則上執行起付標準、支付比例和支付限額，執行參保地當地規定的就醫標準，不按照境外就醫支付比例執行。經本人申請，本人可以將個人賬戶中的資金轉賬給個人，用於門診就醫和購藥。