深圳二類醫保住院報銷比例主要為住院費用，門診年報銷金額為1000元。住院費用報銷比例壹般在70%-80%之間。辦理住院手續時，患者需要出示社保卡並填寫相關信息，出院結算時醫院會直接扣除可報銷費用。根據《深圳市社會醫療保險辦法》，二類醫保參保人員應在選定的社康中心就醫，需要住院或門診大病治療的，應在市內定點醫療機構就醫。此外，城鎮居民在壹個結算年度內住院兩次以上的，從第二次住院起，不再收取最低起付標準費用。轉院或住院兩次以上的，需按規定補足起付標準差額。
醫療保險政策的解釋；
1.基本醫療保險制度:介紹深圳市基本醫療保險的構成、覆蓋範圍和覆蓋面；
2.報銷流程:講解住院報銷的具體流程，包括報銷申請、資料提交、審核的步驟；
3.報銷標準:匯總不同檔次醫保的報銷比例、封頂線、起付線；
4.定點醫療機構:列出深圳市定點醫療機構及其與報銷相關的特殊規定；
5.異地就醫報銷:說明在非定點醫療機構或異地就醫的報銷政策和流程。
綜上所述，深圳二類醫保為參保人提供的住院醫療費用報銷比例大致為70%-80%，年度門診報銷金額限定為1，000元，並有具體的醫療法規政策彌補起付標準之間的差額，降低城鎮居民因病致貧的風險。
法律依據:
深圳市社會醫療保險辦法
第三十二條
基本醫療保險參保人按下列規定享受醫療保險待遇: (壹)基本醫療保險壹類參保人在本市定點醫療機構治療。(二)基本醫療保險二級參保人在選定的社區衛生中心就醫，經結算醫院同意，可在與選定的社區衛生中心同壹結算醫院下的其他定點社區衛生中心就醫；住院和門診大病在本市定點醫療機構就醫。(三)基本醫療保險三級參保人在選定的社區衛生中心就醫，經結算醫院同意，可在與選定的社區衛生中心同壹結算醫院下的其他定點社區衛生中心就醫；門診大病在本市定點醫療機構就醫；在所選社會康復中心的結算醫院住院治療。(四)符合本辦法規定的其他醫療條件。