教育局內設機構:
辦公室:負責重要黨務、政務和綜合協調局事務；起草教育局的工作計劃、總結和相關書面材料的綜合；組織召開黨委、常務會議、局長辦公會議和局級重要會議，並對會議議定事項進行督辦；上級部門和局領導交辦的重要事項的督辦；組織協調全國目標辦下達的各類目標的監督、匯總和上報工作；
負責文秘、機要、檔案、信訪、保密、安全、信息和後勤管理工作；協調全局綜合管理、對外宣傳和政務公開工作；組織編寫教育年鑒和教育期刊；辦理全國人民代表大會和CPPCC的建議；科教興國。
人事部門:全國教育系統人事管理、教師輪崗、表彰、獎懲、人事管理制度改革；教師資格認定；局機關和直屬單位處級幹部任免和備案；調整和管理民族中小學的設置；師範大學畢業生就業指導；直接管理教育局及直屬中小學教職工的招聘和流動手續；管理教師獎勵基金會的工作；教育系統中的智力工作和專家管理。