個人繳納的社保要從工資裏扣。《工資支付暫行規定》明確規定，用人單位可以從工資中扣除勞動者個人應當承擔的各項社會保險費。並及時通知工人自己。
法律客觀性:
勞動部關於印發第十五條用人單位不得克扣勞動者工資。有下列情形之壹的，用人單位可以扣繳勞動者工資: (壹)用人單位代扣代繳的個人所得稅；(二)由用人單位代扣代繳、由勞動者個人承擔的社會保險費；(三)法院判決、裁定要求扣繳的贍養費、扶養費；(四)法律法規規定可以從勞動者工資中扣除的其他費用。