壹是城鎮醫療保險
以未參加城鎮職工醫療保險的城鎮未成年人和失業居民為主要參與者的醫療保險制度。這是黨中央、國務院為進壹步解決廣大人民群眾的醫療保障問題，完善醫療保障措施，對城鎮非從業居民醫療保險作出的制度安排。
第二，農村醫療保險
農村醫療保險是指由政府組織、引導和支持，農民自願參加，以個人、集體和政府多種方式籌集，以大病統籌為主的農民醫療互助共濟制度。而且政府還會對個人繳費進行補貼和集資，有效期為壹年，需要到當地合作醫療管理機構或定點醫療機構醫保結賬窗口報銷。農村醫療保險是互助性的醫療保障制度，在保障農民獲得基本衛生服務和緩解因病致貧、因病返貧方面發揮了重要作用。
1.從保障體系來看，農村醫療保險已經成為國家社會保障的重要組成部分，主要用於保障農村居民的基本醫療問題。隨著農村醫療保險改革，現階段農村醫療保險和城市醫療保險合並為城鄉醫療保險，但它只是為城鄉醫療提供保障。
2.城鎮社會保障主要針對城鎮職工和靈活就業人員，包括醫療保險、養老、工傷、失業、生育等保障制度。其次，在繳費方面，農村醫保，也就是城鄉居民醫保，是按年繳費的，每年都需要繳費，但是如果當年沒有繳納農村醫保，所有的醫療費用都不會報銷。城鎮社保按月繳納，醫療保障部分可以先繳費後立即報銷。但如果繳費期限在3個月以內，可以在繳納保費後的次月享受報銷待遇。如果期限超過3個月，需要連續繳費6個月才能報銷！
3.在報銷比例上，城鎮職工醫保的報銷門檻高於農村醫保。以成都為例，成都市職工醫保起付線標準分別為200元、400元、800元。
4.城鄉居民因病住院醫療保險起付線標準為:鄉鎮衛生院50元，社區衛生服務中心和壹級醫院100元，二級醫院200元，三級醫院500元。對外轉診的起付標準為1000元。
由於城鎮職工醫保按月繳費，年均繳費遠高於農村醫保，報銷比例也遠高於農村醫保。城鎮職工醫保報銷比例三級醫院為85%，二級醫院為90%，壹級醫院為92%，而城鄉居民醫保(按最高級別)報銷比例鄉鎮醫院為90%，社區衛生服務中心和壹、二級醫院為85%。
兩者的投保對象不同。城鎮醫保主要是針對有城鎮戶口的居民；新農合是只有農村戶口的居民才能參保。報銷渠道不壹樣。城鎮醫保報銷在居民居住的社區醫保科，新農合必須到鄉鎮所在的農合組織。