1，繳費基數不同:不同地區的社會經濟發展水平不同，對應的社保繳費基數也不同；個人和單位需要繳納的社保費用也會有差異。
2、待遇影響:異地繳納社保對個人買房和醫保報銷會有壹定影響；買房通常需要當地社保，異地醫保報銷會比較麻煩。
3.社保繳費年限:異地社保雖然最終可以轉移，但只計算累計年限，對參保人的連續繳費年限有壹定影響。
二、社保異地合並的流程:
1.參保人跨省流動前，由原參保地社保經辦機構出具基本養老保險繳費證明。
2.參保人持繳費憑證、戶口本、身份證等。直到新就業地社保機構申請延續關系。
3.新就業地社保經辦機構會在15個工作日內審核申請人是否符合條件。
4.原參保地社保經辦機構收到聯系函後15個工作日內結清申請人的參保繳費。
是否存在欠費和轉移養老保險基金，終止申請人本地參保關系，並向新參保地發放基本養老保險關系轉移接續信息表。
5.新參保地社保機構在收到信息表和轉移基金後15個工作日內完成相關手續。
法律依據:
中華人民共和國社會保險法
第十九條個人跨統籌地區就業的，基本養老保險關系隨本人轉移，繳費年限累計。個人達到法定退休年齡時，基本養老金分段計算，統壹發放。具體辦法由國務院制定。
第三十二條個人跨統籌地區就業的，基本醫療保險關系隨本人轉移，繳費年限累計。
第五十七條用人單位應當自成立之日起30日內，持營業執照、登記證或者單位印章，向當地社會保險經辦機構申請辦理社會保險登記。社會保險經辦機構應當自收到申請之日起十五日內進行審核，並發放社會保險登記證。
城鎮企業職工基本養老保險轉移接續暫行辦法
第三條參保人員跨省流動就業的，由原參保地社會保險經辦機構(以下簡稱社會保險經辦機構)出具參保繳費憑證，基本養老保險關系轉移到新參保地。