第壹，發卡機構不同。
農村保險卡是農村保險卡，由發卡機構生成並寫入發卡機構基本信息、個人基本信息和用戶數字證書，再由相關管理部門寫入個人社保信息和相應密鑰；
社會保障卡由人力資源和社會保障部制定，然後由當地人力資源和社會保障部門發放到各個領域。
2.不同的功能
農保卡以參保人為農村戶籍對象，功能有:管理對象，存儲養老、勞動、醫療、生育等；
社會保障卡除了具有農業保險卡的功能外，還可以用於辦理就業登記和失業登記等相關手續。
農保卡和社保卡可以合並，裏面的余額可以合並，但是繳費年限不能合並。
新農合必須是當地農村戶口才能參加。按照相關要求，當年和次年繳費後才能享受保險。社保就是我們所說的五險:養老保險、失業保險、工傷保險、醫療保險、生育保險。
新型農村合作醫療和社會保障可以不存在，但可以相互轉化；其中新農合的使用壹般只和城鎮居民和職工醫保有沖突，大家要註意不要再次參保。