權限:省級醫保的主管機關是省醫保局下屬的省醫保中心，市級醫保是各市醫保局下屬的市醫保中心和縣醫保中心。
參保對象:省級醫保的主要參保對象為省直單位，如省直機關、省直事業單位、中央在省級派駐的辦事機構和事業單位、省屬企業和中央駐省級企業的分支機構、在省級市場監管部門註冊的企業等。市級醫療保險的參保對象為市級行政區域內的機關事業單位、企業職工和靈活就業人員。
醫療保險制度規定:我國醫療保險制度由各統籌地區制定。因此，省級醫保和市級醫保屬於不同的統籌地區，醫保實施細則的規定也會有所不同。個人賬戶返還比例和醫保住院報銷比例有細微差別。
社會保障卡:省級醫保使用的社會保障卡由省人力資源和社會保障廳發放，市級醫保使用的社會保障卡由市人力資源和社會保障廳發放。上面的公章是某省人力資源和社會保障廳或者某市人力資源和社會保障局。