學院現有兩院院士26人。
北京協和醫學院是雙壹流大學，國家重點，優秀博士，科研合格，雙百萬計劃大學，有八個壹流博士授權點。
排名前三的醫科大學分別是北京協和醫科大學、海軍軍醫大學和首都醫科大學。
1北京協和醫學院。
北京協和醫學院位於北京，是國家衛生健康委員會直屬的全國重點大學，與中國醫學科學院實行統壹管理體制。是國家“雙壹流”建設高校，入選卓越博士教育培養計劃和醫學“雙壹流”建設聯盟成員。
學校的前身是協和醫學院，由美國和英國基督教會於1906年創辦。經過傳承發展，學校先後更名為中國醫科大學、中國首都醫科大學、北京協和醫學院。2006年被命名為北京協和醫學院。
2.海軍醫科大學。
海軍軍醫大學壹般指解放軍海軍軍醫大學。位於上海，成立於9月，1949。當時叫華東軍區人民醫學院。它主要由華東醫學幹部學校、第三野戰軍衛生部醫學院、國民黨原國防醫學院的部分大陸人員和從地方招聘的專家教授組成。
3.首都醫科大學。
首都醫科大學創建於1960，是北京市政府、國家衛生健康委員會、教育部共建的北京市重點高等學校。學校與美國、加拿大、澳大利亞、英國、瑞典、挪威、香港和臺灣省等20個國家和地區的50多所大學及相關單位簽訂了友好交流合作協議。