學校秉承“公共能力”的教育理念，在遵循重慶南開中學課程體系的基礎上，結合STEAM教育體系，開設適合學生發展需求的課程。南開兩江中學的特色課程體系，既保證了學生基礎必修課的紮實學習，又通過選修課和自修課的學習激活了學生的學習興趣，促進了興趣焦點和潛能的匹配，保證了不同智力發展方向學生的個性化發展。
學校與北京理工大學、重慶大學、四川美術學院等知名高校共建課程，深入推進大中學課程整合和模塊化教學，與國內外高校和實驗室開展深度合作，引導學生在基礎教育階段開展自動化、人工智能、機器人、無人機等項目研究，為新工科教育做好銜接。
重慶南開兩江中學是壹所依法舉辦的現代化、創新型、學術性民辦中學。學校占地220畝，總建築面積約10.9萬平方米。這裏不僅有配備無人機、3D建模、人工智能等高科技實驗室的科技館，還有配備沙畫、陶藝體驗室的美術館，還有可以進行文化創意設計、高端大氣的圖書館。遍布全國的智能校園管理系統，彰顯現代辦學理念。