根據上述職責，清鎮市人力資源和社會保障局設6個內設機構：
（壹）辦公室（黨委辦公室）
負責文電、會務、宣傳、機要、檔案、安全、保密和後勤保障等機關日常運轉工作；負責政務公開、目標管理、社會治安綜合治理、計劃生育等工作；負責局機關和所屬單位機構編制及幹部人事工作；擬定幹部職工培訓計劃並組織實施。承辦黨委的日常工作。
（二）公務員管理科（市軍轉幹部安置辦公室）
貫徹執行公務員職位分類管理及聘任制公務員管理規定；負責公務員日常登記管理工作；綜合管理公務員職務任免與升降、交流與回避、錄用與調配、辭職與辭退工作；會同有關部門開展全市參照公務員法管理單位的申報和管理工作。綜合管理本市國家公務員隊伍建設，指導人員定崗分流工作；擬訂公務員培訓和在職教育規劃、計劃；組織公務員培訓；貫徹執行公務員行為規範、職業道德建設和能力建設政策，依法對公務員實施監督；完善公務員考核制度，組織實施公務員和參照公務員法管理單位工作人員的考核工作；負責公務員申訴控告工作；初步審核報請市人民政府批準的獎勵人選和處分。承辦轉業軍官的接收、安置和培訓工作；負責協調有關部門做好轉業軍官隨調（遷）家屬的安置工作；貫徹執行企業軍隊轉業幹部解困和穩定政策；指導自主擇業軍隊轉業幹部管理服務工作；承辦市軍隊轉業幹部安置工作小組的具體工作。
（三）事業單位人事管理科（市職稱改革辦公室）
指導事業單位人事制度改革和人事管理工作；指導監督實施事業單位工作人員公開招聘、聘用及崗位管理工作；負責事業單位工作人員聘用、調配、考核、獎勵、處分、辭職、辭退等工作；做好大中專畢業生就業指導工作；負責事業單位幹部培訓和幹部統計年報工作。綜合管理本市人才資源規劃、開發和農村鄉土人才開發工作；綜合管理專業技術人員隊伍建設和專業技術隊伍職稱工作；負責專業技術人員培訓、評審、推薦、管理和農村鄉土人才培訓、評審和管理工作。
（四）工資福利與退休科
貫徹執行國家、省、貴陽市關於機關、事業單位人員工資、福利和退休退職政策；負責機關、事業單位工資政策實施和工資統發工作；貫徹執行機關、事業單位津貼、補貼制度；綜合管理機關、事業單位的工資福利和離（退）休、退職人員生活待遇工作；協調機關、事業單位退休人員的管理服務工作；負責機關、事業單位工作人員提前退休手續辦理工作；負責工資年報工作；負責機關、事業單位技術工人技術等級考評和推薦工作；指導全市企業職工工資管理工作。
（五）政策法規信息科
貫徹實施國家、省、貴陽市人力資源和社會保障的方針、政策和法律、法規；組織開展全市人力資源和社會保障政策研究工作；承擔機關規範性文件的擬定工作；負責人力資源和社會保障政策、法規的相關銜接與協調工作；負責辦理行政復議、行政訴訟、應訴和行政賠償案件；研究制定全局幹部職工監督制度和考核辦法；負責對外政策咨詢；負責本部門行政執法監督工作；組織辦理人大代表建議、政協委員提案；承擔人力資源和社會保障網站信息公開的審核、綜合協調在線咨詢投訴回復工作；負責信息的審核、上報、發布和對外宣傳工作；承擔市人力資源和社會保障網站的日常維護、運行和資源上掛等工作。
（六）基金監督管理科
擬訂全市就業專項資金、社會保險及其補充保險基金監督制度；承擔市就業專項資金和社會保障基金監督管理工作；負責就業專項經費、社保基金的拔付、使用的監督管理；受理基金管理投訴舉報並組織查處相關案件；承擔就業專項資金和社保基金的內部財務審計工作。
機關黨組織按有關規定設置。
紀檢監察機構按有關規定設置。