企業會計服務的主體是以企業為主體，以其經營資金的運動為客體，以提高企業經濟效益為目的的管理活動。非營利組織的會計服務主體是政府機關和其他非營利組織(如學校、醫院、科研機構、圖書館、慈善機構)。
2、分類不同
按照企業的性質，企業會計包括商業企業會計、工業企業會計、農業企業會計、建築企業會計和運輸企業會計。根據會計的內容和重點，有財務會計和管理會計。非營利組織會計分為三部分:財務預算會計、行政單位會計和事業單位會計。
3.會計基礎不同
企業會計以權責發生制為記賬基礎，正確計算損益。目前非營利組織的會計確認采用收付實現制，權責結合得當。
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