吉林大學基礎醫學院成立於1951年5月。原為白求恩醫科大學基礎醫學系，1992由“系”改為“學院”。是吉林大學集基礎醫學教育和科學研究於壹體的重要教學基地。
作為世界壹流大學A類建設的壹部分，Xi交通大學醫學院負責Xi交通大學醫學教育教學、科研和醫療服務的全面管理。
該系是中國醫學科學院Xi分院，全國首批招收七年制臨床醫學專業的重點醫學院校，臨床醫學專業(5+3)壹體化培養試點學院，教育部首批“拔尖創新型醫學人才培養模式改革”試點單位，全國首家以英語培養醫學生的高校。
Xi交通大學醫學中心的歷史沿革
1981年11月，經國務院批準，學校成為全國首批博士、碩士學位授予單位。
1985，經教育部批準，Xi安醫學院更名為Xi安醫科大學。
1991 7月，中國醫學科學院Xi安分院在Xi醫科大學成立。
2000年4月，國務院將原xi醫科大學、原陜西財經大學和原Xi交通大學合並，組建新的Xi交通大學。Xi醫科大學更名為Xi交通大學醫學院。
2012年6月，根據教育部關於醫學教育改革的文件精神，成立Xi交通大學醫學部。
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