分類總是多種多樣的。壹般來說可以分為兩類:PCR擴增儀和實時熒光PCR儀。也有人稱之為半自動和全自動，或者定性和定量，這些都是不準確的名稱。
PCR最重要的是升溫和降溫的過程。原來的水浴PCR是三個水浴箱和壹個機械臂，定期取出反應罐換成水浴鍋。這玩意體積大，又快又慢，但其實結果並不比後來的PCR儀差，我現在很欣賞。後來有人用制冷加熱的方法，做了壹個固定升降溫的PCR擴增儀。
後來隨著定量技術的發展，壹些公司將擴增儀與檢測集成在壹起，成為所謂的自動(或定量)PCR儀。當然，標準叫實時熒光定量PCR儀。
品牌
壹切都有品牌。現在國內外有很多品牌的PCR儀。就國外而言，比較著名的有:
ABI美國應用生物公司:老牌生物公司貴族，買的是原裝PE，PE公司是PCR的鼻祖，有很多經典的PCR儀器，包括5700(停產)、7700(停產)、7000、7900等實時熒光定量PCR儀器。
羅氏羅氏的診斷:炙手可熱的新貴LIGHTCYCLER是其唯壹的PCR儀器。市場做的很好，以科研為主。不過國內很多醫院都在用。它是最獨特的PCR儀器，具有獨特的離心、氣體加熱和毛細管設計。當然質量是另壹回事，所以其獨特的技術能力和膽識是值得敬佩的。
MJ:壹個剛剛進入中國的名人，MJ的放大器在生命科學研究領域很有名氣，產品比較適合高通定量檢測，廣泛應用於人類基因組計劃。實際上，實時熒光PCR儀剛剛進入中國，它的特點是能夠利用井間不同的溫度。這個其實更有用。
伯樂:啊，便宜的麥當勞，ICYCLER是它的主打產品。在中國已經很久了。產品和5700壹樣，是在放大器上增加了壹個定量模塊，特點是價格更低。
國內也有很多項目，如杭州博裏、杭州姬閬、上海風鈴、廈門安普利等。
選擇和購買
準確的說是沒有自動加樣和樣品處理系統，包括實時熒光定量，只能算是半自動。PCR儀就是壹個簡單的東西，壹個溫控裝置，壹個檢測裝置。
關於溫度控制，主要是介質問題。理想的介質是導熱性好、比熱大、接觸緊密的東西。
這方面最好的是水浴和油浴，它們比熱高(油大於水)，物體溶劑化，與反應物接觸無縫，效果當然最好。但自動化和小型化難度較大，僅采用最初的水浴鍋式。
矽加熱，是最常用的壹種，具有易自動化、速度快、直接加熱冷卻、效果好等優點，但首次成本高。其次，使用的介質是金屬，導熱性能好，但很難與反應管無縫接觸。定性的時候可以加油，但是可以用熒光設定溫度，因為油有熒光信號，所以不能用。所以在無縫接觸中更差。再次，因為是底部加熱，下部壓力大，可能會溢出，但新儀器加熱蓋子後解決了這個問題。
空氣加熱，以空氣為介質，具有與反應體系無縫接觸的優點，但空氣有導熱性能差、比熱小的明顯弱點。所以空氣加熱要利用離心產生氣流，增強導熱性，同時利用毛細管，增加接觸面積，微量試劑來彌補。這樣做了之後，效果還是不錯的。但是有些廠家大談離心和毛細管的優點，卻閉口不談氣體加熱的弱點，這是壹種巧妙的市場手法。同時，離心的使用對標本量的增加有影響，標本量越大，空氣比熱低的弱點越明顯，所以空氣加熱的儀器標本量相對較少。使用毛細管後，反應液與管的接觸面積增大，吸附現象更大。因此，試劑的通用性差，成本高。雖然試劑用量少，但因為是特殊試劑，所以每種試劑都是按實際用量計算，不節約試劑。但是增加了毛細管成本。
關於功能，所有的PCR儀基本都是壹樣的。唯壹的是只有MJ孔可以使用不同的溫度，這對於同時檢測多個項目和調整循環參數是有用的。但實時熒光儀剛剛進入中國，具體情況還不得而知。
關於購買，要看公司的情況。因為PCR的技術含量其實不高，好的國產儀器比如杭州博日(和日本著名廠商大和有關)也不算太差。至於進口儀器，羅氏的儀器不錯，但是如果標本數量多，建議不要用羅氏。壹個會筋疲力盡。此外，每個樣本共享的標準曲線和對照的成本太高。同時，試劑也是有限的。