醫院是國家藥物臨床試驗機構,下設9個專業組。重慶醫科大學病毒性肝炎研究所、重慶醫科大學超聲工程研究所、超聲影像研究所、教育部和重慶市共建的傳染病分子生物學重點實驗室就設在我院。流行病學為國家重點學科,包括婦產科等12重慶市重點學科和重慶市肝病治療研究中心等9個市級醫學中心。
近年來,醫院科研取得長足進步,獲得國家自然科學“863計劃”、“973計劃”等各級項目380余項,研究經費總計3367萬元。獲得國家技術發明二等獎、重慶市科技進步壹等獎等68項科技獎勵。主辦中華肝臟病雜誌,臨床超聲醫學雜誌和肝博士。
作為中國西部歷史最悠久的醫院之壹,醫院正全力打造成為重慶CBD標誌性城市醫院,並正在籌建江南國際醫院,目標是成為國內壹流醫院。