北京大學口腔醫院第三門診部診斷科室，分為8大科室：牙體牙髓科、牙周科、修復科、正畸中心、種植外殼、兒童口腔科、醫學影像科、護理團隊。 北大口腔醫院第二門診部口腔頜面外科是壹門以外科手段診治口腔頜面疾病的學科，診療範圍包括：口腔牙槽外科（包括各類復雜牙、阻生齒和多生牙的拔除等）、頜骨病變、口腔頜面部創傷、腫瘤、涎腺及顳下頜關節疾病等。
北大口腔醫院第二門診部與總院及第壹門診部口腔頜面外科保持著密切的聯系，彼此相互合作，相互支持，使我科壹方面整體綜合醫療水平持續提高，壹方面學科能向縱深發展跟上國內、外先進水平。我科目前開展的治療有各類牙齒的拔除，包括阻生齒、復雜牙、埋伏牙和各種多生牙的拔除等，各類牙槽外科小手術，頜骨囊性病變的診斷和治療，頜面部腫瘤以及涎腺疾病的診斷和治療。
我科開展的特色醫療項目為種植機輔助下的微創拔牙技術，使各種阻生齒、埋伏牙的拔除時間明顯縮短，創傷減小，術後的反應也明顯減輕。且由於整個拔牙過程中不再用傳統的劈開和骨鑿技術，患者在整個拔牙過程種的主觀感受的舒適度明顯提高，術後恢復的時間明顯縮短，得到了患者的壹致好評。 種植牙是現代最先進、患者感覺最舒適的牙缺失修復技術，它是在缺牙處的牙床裏手術植入壹個人工牙根（牙種植體），然後在植入的種植體上方連接牙冠，恢復牙齒的功能，適用於單牙缺失、多牙缺失及全口牙缺失。
種植門診的牙種植工作由頜面外科、修復科和牙周科醫師合作完成，在為患者實施種植手術前，種植門診的外科醫師、修復醫師和牙周醫師將會聯合會診，為每位患者提供全面的口腔檢查及治療設計。壹般在拔牙後三個月進行種植手術植入牙根，手術後2-4個月在牙根上修復牙冠。修復完成後的種植牙由牙周醫生維護健康。
在某些情況下也可以在拔牙後立即完成牙種植和修復，其療效同樣可靠。 北大口腔醫院第二門診部牙體牙髓科現有醫生8名，其中教授1名，主治醫師3名，住院醫師4名。醫生中有博士學位1名，碩士學位3名。
臨床業務範圍包括齲病、牙髓病和根尖周病的診斷和系統治療，牙齒硬組織發育缺陷的診斷和治療，牙齒醫療美學修復等。治療中嚴格保證“1人1牙科鉆頭制”，積極應用與國際接軌的新技術新療法，提高患者治療舒適度和醫療工作質量。
科室承擔北京大學口腔醫院本科生教學任務。科室內定期組織業務學習交流活動，並有北京大學口腔醫院知名教授定期來科內指導臨床工作。
北大口腔醫院第二門診部牙體牙髓科的所有醫生護士希望以熱情周到的服務，高超嫻熟的技術為廣大患者解除病痛。 正畸科是壹個專門從事口腔正畸臨床工作的專業化科室，擁有幽靜舒適的候診環境，先進的醫療設備與技術精湛的醫護隊伍，全科現有正畸醫師6人，均接受過北京大學口腔醫院規範嚴格的正畸訓練，多數還擁有口腔正畸博士或碩士學位。正畸科以先進的設備、治療技術、管理系統及操作規範，為患者提供滿意的服務。為了解除家長上班，孩子上學，平時沒有時間看牙的煩惱，正畸科開設了晚間門診，周六日照常門診。
北京大學口腔醫院第二門診部正畸科不僅對各種類型的錯頜畸形的患者進行綜合性正畸治療，而且開展了許多特色性治療。如舌側隱形矯治技術，invisalign隱形矯治技術，種植支抗，以及正頜外科患者的術前、術後正畸治療，牙周病患者的正畸治療，顳下頜關節病的正畸治療和睡眠呼吸暫停綜合癥的治療，具有較高的矯治水平。 我們的服務對象為0-18歲兒童。這裏醫護隊伍臨床經驗豐富，醫療設備材料先進，治療環境輕松舒適。
兒童隨年齡的增長有不斷生長發育變化的特點，應該每半年進行壹次口腔檢查，對於齲齒易感的兒童需要每三個月檢查壹次。 專長於口腔常見病、多發病的診斷及治療，如齲齒、牙髓根尖周疾病、牙周組織疾病、智齒拔除等疾病的綜合治療。科內醫師均具備全面的口腔知識，能為您及您的家人提供細致周到的口腔服務。